MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Alteromonas sp. SN2 chromosome

Total Repeats: 93653

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_015554	A	9	9	53743	53751	100 %	0 %	0 %	0 %	333891529
1002	NC_015554	TCGA	2	8	53758	53765	25 %	25 %	25 %	25 %	333891529
1003	NC_015554	TGC	2	6	53783	53788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891529
1004	NC_015554	A	6	6	53791	53796	100 %	0 %	0 %	0 %	333891529
1005	NC_015554	T	6	6	53808	53813	0 %	100 %	0 %	0 %	333891529
1006	NC_015554	GATG	2	8	53816	53823	25 %	25 %	50 %	0 %	333891529
1007	NC_015554	GAA	2	6	53985	53990	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891529
1008	NC_015554	GCA	2	6	54012	54017	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891529
1009	NC_015554	CAAA	2	8	54059	54066	75 %	0 %	0 %	25 %	333891529
1010	NC_015554	A	7	7	54099	54105	100 %	0 %	0 %	0 %	333891529
1011	NC_015554	TGG	2	6	54151	54156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891529
1012	NC_015554	AAG	2	6	54179	54184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891529
1013	NC_015554	CTT	2	6	54189	54194	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891529
1014	NC_015554	TGAT	2	8	54207	54214	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_015554	A	6	6	54230	54235	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_015554	ACA	2	6	54257	54262	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_015554	CCA	2	6	54475	54480	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1018	NC_015554	T	6	6	54482	54487	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1019	NC_015554	TGA	2	6	54554	54559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_015554	GCTC	2	8	54579	54586	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1021	NC_015554	ATA	2	6	54730	54735	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_015554	AAAAG	2	10	54744	54753	80 %	0 %	20 %	0 %	333891530
1023	NC_015554	ACT	2	6	54814	54819	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891530
1024	NC_015554	ACT	2	6	54835	54840	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891530
1025	NC_015554	TTCT	2	8	54842	54849	0 %	75 %	0 %	25 %	333891530
1026	NC_015554	GGT	2	6	54859	54864	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333891530
1027	NC_015554	GAA	2	6	54901	54906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891530
1028	NC_015554	TGC	2	6	55023	55028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891530
1029	NC_015554	GATG	2	8	55032	55039	25 %	25 %	50 %	0 %	333891530
1030	NC_015554	TAG	3	9	55049	55057	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891530
1031	NC_015554	GTC	2	6	55106	55111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891530
1032	NC_015554	CAT	2	6	55128	55133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891530
1033	NC_015554	TGA	3	9	55161	55169	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891530
1034	NC_015554	TAG	2	6	55184	55189	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891530
1035	NC_015554	CTT	2	6	55207	55212	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891530
1036	NC_015554	GAAAA	2	10	55294	55303	80 %	0 %	20 %	0 %	333891530
1037	NC_015554	CAGAGC	2	12	55340	55351	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891530
1038	NC_015554	TTC	2	6	55373	55378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891530
1039	NC_015554	AGT	2	6	55416	55421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891530
1040	NC_015554	GAA	2	6	55459	55464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891530
1041	NC_015554	GAC	2	6	55497	55502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891530
1042	NC_015554	CTT	2	6	55531	55536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891530
1043	NC_015554	TTC	2	6	55568	55573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891530
1044	NC_015554	TCAA	2	8	55630	55637	50 %	25 %	0 %	25 %	333891530
1045	NC_015554	CA	3	6	55640	55645	50 %	0 %	0 %	50 %	333891530
1046	NC_015554	TTC	2	6	55705	55710	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891530
1047	NC_015554	GTA	2	6	55816	55821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891530
1048	NC_015554	A	8	8	55940	55947	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1049	NC_015554	T	6	6	55966	55971	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_015554	CCAT	2	8	56029	56036	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1051	NC_015554	CT	3	6	56091	56096	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1052	NC_015554	CCAT	2	8	56138	56145	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_015554	AG	3	6	56174	56179	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_015554	CCTT	2	8	56199	56206	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1055	NC_015554	CCAT	2	8	56264	56271	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1056	NC_015554	CT	3	6	56326	56331	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1057	NC_015554	CATG	2	8	56374	56381	25 %	25 %	25 %	25 %	333891531
1058	NC_015554	GCA	3	9	56390	56398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891531
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1060	NC_015554	GAG	2	6	56420	56425	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333891531
1061	NC_015554	CTTC	2	8	56435	56442	0 %	50 %	0 %	50 %	333891531
1062	NC_015554	TCA	2	6	56477	56482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891531
1063	NC_015554	ATCC	2	8	56497	56504	25 %	25 %	0 %	50 %	333891531
1064	NC_015554	TGC	2	6	56506	56511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891531
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1068	NC_015554	TCT	2	6	56659	56664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1069	NC_015554	TCA	2	6	56698	56703	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_015554	ATCC	2	8	56718	56725	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_015554	TGC	2	6	56727	56732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_015554	GCC	2	6	56758	56763	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1073	NC_015554	CAA	2	6	56769	56774	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1074	NC_015554	TAA	2	6	56784	56789	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_015554	GT	3	6	56869	56874	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1076	NC_015554	CAA	2	6	56881	56886	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_015554	TCT	2	6	56959	56964	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1078	NC_015554	GT	3	6	57023	57028	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_015554	GAT	2	6	57029	57034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1080	NC_015554	GCAG	2	8	57039	57046	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
1081	NC_015554	ATA	2	6	57104	57109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_015554	TGAT	2	8	57111	57118	25 %	50 %	25 %	0 %	333891532
1083	NC_015554	T	6	6	57128	57133	0 %	100 %	0 %	0 %	333891532
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1086	NC_015554	CTAT	2	8	57419	57426	25 %	50 %	0 %	25 %	333891532
1087	NC_015554	TAC	2	6	57451	57456	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891532
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1089	NC_015554	AGG	2	6	57499	57504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333891532
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1096	NC_015554	GTTT	2	8	57813	57820	0 %	75 %	25 %	0 %	333891532
1097	NC_015554	ATG	2	6	57993	57998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891532
1098	NC_015554	GGCG	2	8	58021	58028	0 %	0 %	75 %	25 %	333891532
1099	NC_015554	GTT	2	6	58033	58038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891532
1100	NC_015554	CAA	2	6	58066	58071	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891532
1101	NC_015554	TTG	2	6	58084	58089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891532
1102	NC_015554	ATT	2	6	58195	58200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333891532
1103	NC_015554	TGA	2	6	58210	58215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891532
1104	NC_015554	ACG	2	6	58398	58403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891532
1105	NC_015554	TATG	2	8	58519	58526	25 %	50 %	25 %	0 %	333891533
1106	NC_015554	TC	3	6	58591	58596	0 %	50 %	0 %	50 %	333891533
1107	NC_015554	GTTAA	2	10	58650	58659	40 %	40 %	20 %	0 %	333891534
1108	NC_015554	TTG	2	6	58668	58673	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891534
1109	NC_015554	TAA	2	6	58826	58831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_015554	TGT	2	6	58855	58860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_015554	TAT	2	6	58940	58945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_015554	AGC	2	6	59002	59007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_015554	TAA	2	6	59038	59043	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333891535
1114	NC_015554	CTG	2	6	59146	59151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891535
1115	NC_015554	AGT	2	6	59234	59239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891535
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1117	NC_015554	TGC	2	6	59306	59311	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891535
1118	NC_015554	TCA	2	6	59358	59363	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891535
1119	NC_015554	TAG	2	6	59452	59457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891535
1120	NC_015554	AAC	2	6	59460	59465	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333891535
1121	NC_015554	TAAC	2	8	59536	59543	50 %	25 %	0 %	25 %	333891535
1122	NC_015554	CTT	2	6	59570	59575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891535
1123	NC_015554	CA	3	6	59598	59603	50 %	0 %	0 %	50 %	333891535
1124	NC_015554	ATGG	2	8	59652	59659	25 %	25 %	50 %	0 %	333891535
1125	NC_015554	TGA	3	9	59687	59695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891535
1126	NC_015554	AACC	2	8	59733	59740	50 %	0 %	0 %	50 %	333891535
1127	NC_015554	TGA	3	9	59949	59957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_015554	CAG	2	6	60102	60107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891536
1129	NC_015554	TGA	2	6	60133	60138	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891536
1130	NC_015554	GAT	2	6	60146	60151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891536
1131	NC_015554	TTC	2	6	60170	60175	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891536
1132	NC_015554	GTT	2	6	60217	60222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333891536
1133	NC_015554	CAG	2	6	60227	60232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891536
1134	NC_015554	TGC	2	6	60261	60266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891536
1135	NC_015554	AGGA	2	8	60294	60301	50 %	0 %	50 %	0 %	333891536
1136	NC_015554	TGTT	2	8	60396	60403	0 %	75 %	25 %	0 %	333891536
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1139	NC_015554	TGA	2	6	60543	60548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333891536
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1143	NC_015554	AC	3	6	60677	60682	50 %	0 %	0 %	50 %	333891536
1144	NC_015554	CTT	2	6	60796	60801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333891536
1145	NC_015554	GAA	2	6	60865	60870	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333891536
1146	NC_015554	TCAG	2	8	60888	60895	25 %	25 %	25 %	25 %	333891536
1147	NC_015554	CA	3	6	60934	60939	50 %	0 %	0 %	50 %	333891536
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1150	NC_015554	CA	3	6	61134	61139	50 %	0 %	0 %	50 %	333891536
1151	NC_015554	TCA	2	6	61168	61173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333891536
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1161	NC_015554	GCA	2	6	61613	61618	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891537
1162	NC_015554	GGC	2	6	61749	61754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	333891537
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1164	NC_015554	GCA	2	6	61779	61784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	333891537
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1173	NC_015554	GCCA	2	8	62139	62146	25 %	0 %	25 %	50 %	333891537
1174	NC_015554	A	7	7	62261	62267	100 %	0 %	0 %	0 %	333891537
1175	NC_015554	A	6	6	62329	62334	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1176	NC_015554	CTG	2	6	62395	62400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333891538
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1198	NC_015554	ACC	2	6	63333	63338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1211	NC_015554	TAGA	2	8	64120	64127	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
1212	NC_015554	AGT	2	6	64147	64152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1255	NC_015554	TTAT	2	8	66554	66561	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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